在东京都内，发生了在遗体上留下“X”痕迹的杀人事件。本应负责案件的刑警·安堂源次（安田显饰）被排除在搜查之外。因为和以前自己的妻子成为受害者的连续杀人一样的犯人的可能性很高。因此，搜查本部向被称为天才科学家的神保仁（田中圭饰）请求协助搜查。神保对事件的解决毫无兴趣。源次被那个异想天开的行动和言行弄得团团转。但是两人渐渐开始合拍。然后，两人孤独的DNA搜查，发现了搜查本部也没有发现的“某个痕迹”。在这种情况下，发生了“杀人鬼X”更进一步的杀人事件…。