《天才麻将少女》讲述21世纪有两位天才女高中生，降临在这个靠打麻将实力来左右人生的时代。一位是每一次都能够以正负0分没输没赢的方式打完牌局的少女宫永咲；另一位是在全国中学生麻将大赛个人组中夺冠的少女，经验数据系选手原村和。因某次偶然的相会，和被咲不在乎输赢的打法所击败，咲对和说出“我不喜欢麻将”这句话。和被这一句话刺激后，激起了斗争心。另一方面咲为了追赶姐姐而加入和所在的学校麻将部，两位少女就此向麻将界的顶点进发。