在大海的最深处，传说中美丽可爱的美人鱼安妮重生，正当鱼群庆祝诞生舞会之时，一艘军舰遇到风暴，威廉船长女儿索菲尔不慎被大浪卷进海里，美人鱼不顾海神的劝阻救了小女孩，跟她一起踏入人类世界去找小女孩的父亲。 
　　在小镇里，索菲因为一只猴子得罪了大海盗汤姆和迪夫，安妮为了保护她，和海盗斗智斗勇，让海盗汤姆受尽了苦头。关键时候，威廉船上的水手们把海盗制服，并让安妮和索菲一起上大船，索菲也顺利回到了自己的船长爸爸威廉身边！ 
　　正当大家以为一切结束时，大船却接一连三地出现危机，鱼群的阻挡，鲸鱼的撞击，还有海盗王汤姆和迪夫一次又一次的发难，让全船险象环生。美人鱼用自身的勇气和智慧化解了一次次危机。最后为了救人陷入了更大的危险当中……